RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
RNPS1-222	ENST00000567147	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
RNPS1-222	ENST00000567147	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RNPS1-222	ENST00000567147	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LY6L	H3BQJ8	138 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OPN1MW	P04001	364 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CEL	P19835	753 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	SERPINA2	P20848	420 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	BRS3	P32247	399 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	GLP1R	P43220	463 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	KCNJ3	P48549	501 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	TAS2R43	P59537	309 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147		Q6ZS46	218 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	KIRREL1	Q96J84	757 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OR14A2	Q96R54	314 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	VCX	Q9H320	206 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	IFT22	Q9H7X7	185 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CALY	Q9NYX4	217 aa		14.02	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MYL12B	O14950	172 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	VSIG8	P0DPA2	414 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CEACAM3	P40198	252 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	WNT4	P56705	351 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	PAX5	Q02548	391 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	DOC2B	Q14184	412 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	RFESD	Q8TAC1	157 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	COL7A1	Q02388	2944 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A1W2PP11	408 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV3-7	P01780	117 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	GTF2F2	P13984	249 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGDIB	P52566	201 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LOXL3	P58215	753 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LTC4S	Q16873	150 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	REC114	Q7Z4M0	266 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OR9G1	Q8NH87	305 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LEAP2	Q969E1	77 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OR5M11	Q96RB7	305 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		14	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147		J3QR06	171 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	PEX14	O75381	377 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	IL1A	P01583	271 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MAS1	P04201	325 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CD1A	P06126	327 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	FST	P19883	344 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	GPR176	Q14439	515 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MUL1	Q969V5	352 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CD28	P10747	220 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	GZMH	P20718	246 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	SSTR5	P35346	364 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MNDA	P41218	407 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	SGCD	Q92629	289 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	MMP28	Q9H239	520 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RNPS1-222	ENST00000567147	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17

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