RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 CSN2P05814 226 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 TMEM225BP0DP42 221 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 HTR1FP30939 366 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 RAB7AP51149 207 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZSCAN26Q16670 478 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 LPCAT4Q643R3 524 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 UTS2BQ765I0 119 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR8H3Q8N146 312 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 Q8N9W7 124 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 C10orf35Q96D05 121 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ABCG5Q9H222 651 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FRRS1LQ9P0K9 344 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 TRAV24A0A0B4J272 114 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 LCE6AA0A183 80 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 CCRL2O00421 344 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 CALB2P22676 271 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FOXE3Q13461 319 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 TMEM244Q5VVB8 128 aa12.57□□□□□ -0.4
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CS-227ENST00000551441 CHST4Q8NCG5 386 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR51T1Q8NGJ9 327 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR13C3Q8NGS6 347 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR10K1Q8NGX5 313 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SPSB1Q96BD6 273 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 GNB4Q9HAV0 340 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 MYRFQ9Y2G1 1151 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 HCKP08631 526 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FLOT2Q14254 428 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 DNAJC9Q8WXX5 260 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SORL1Q92673 2214 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ELANEP08246 267 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 F2RL1P55085 397 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ISL1P61371 349 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 EBI3Q14213 229 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 Q8N6K4 173 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR2T10Q8NGZ9 312 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 CNIH3Q8TBE1 160 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 NRBF2Q96F24 287 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 KCTD7Q96MP8 289 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 MBOAT4Q96T53 435 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 RASL11BQ9BPW5 248 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 KLK15Q9H2R5 256 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 PLSCR3Q9NRY6 295 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 MPZL2O60487 215 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 VDAC1P21796 283 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZP1P60852 638 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 GNB1P62873 340 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 CFHR3Q02985 330 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 FHL3Q13643 280 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 PIGYQ3MUY2 71 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 OR1N2Q8NGR9 330 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 CCDC107Q8WV48 283 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 EME1Q96AY2 570 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 RNFT2Q96EX2 444 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 S1PR3Q99500 378 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 BARHL1Q9BZE3 327 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 WSB1Q9Y6I7 421 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SLC31A2O15432 143 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 HTR1AP08908 422 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SPNP16150 400 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 MYF6P23409 242 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 KISS1Q15726 138 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SATL1Q86VE3 508 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 SAXO1Q8IYX7 474 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 RNF152Q8N8N0 203 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 DCUN1D4Q92564 292 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 GON7Q9BXV9 100 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-227ENST00000551441 G3V2T6 193 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-227ENST00000551441 G3V318 75 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-227ENST00000551441 J3QLW9 94 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-227ENST00000551441 RRP9O43818 475 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
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