RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490		A0A087X0M5	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490		A0A1B0GX30	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ODAM	A1E959	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490		E9PQ18	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490		M0QZK8	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	DEGS1	O15121	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	KDM4B	O94953	1096 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OCM2	P0CE71	109 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF44	P15621	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	NFYB	P25208	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CD34	P28906	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	MNDA	P41218	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	PTGFR	P43088	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR3A4P	P47883	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	THBS3	P49746	956 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ISL1	P61371	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF85	Q03923	595 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	HNF4G	Q14541	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490		Q6P435	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	DPF1	Q92782	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	EME1	Q96AY2	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	COQ2	Q96H96	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490		J3QR06	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ISG15	P05161	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CSN2	P05814	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	HTR1A	P08908	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CGB3	P0DN86	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CGB7	P0DN87	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	FAS	P25445	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	MYCNOS	P40205	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	BNIP1	Q12981	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	TMED1	Q13445	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	HES1	Q14469	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR56B4	Q8NH76	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DYRK4-208	ENST00000539490	RFK	Q969G6	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.6 ms