RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516680.1

RNU6-197P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 197, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-197P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-197P-201ENST00000516680 REG3AQ06141 175 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FMODQ06828 376 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 PNOCQ13519 176 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 EDDM3AQ14507 147 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 EBPQ15125 230 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 RSU1Q15404 277 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SLC9A3R2Q15599 337 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TSNQ15631 228 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 C4orf26Q17RF5 130 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TMEM183BQ1AE95 376 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 CEACAM16Q2WEN9 425 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ZNF404Q494X3 552 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 C6orf99Q4VX62 202 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 LIN52Q52LA3 116 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SMUG1Q53HV7 270 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 CENPWQ5EE01 88 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ACSBG2Q5FVE4 666 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TMEM255AQ5JRV8 349 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM78AQ5JUQ0 283 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ZNF684Q5T5D7 378 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 C1orf195Q5TG92 126 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM78BQ5VT40 261 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 HACD4Q5VWC8 232 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TMEM236Q5W0B7 351 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FBXW9Q5XUX1 488 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM173BQ6P4H8 233 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 GUSBP11Q6P575 273 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 XKRXQ6PP77 449 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FBXW12Q6X9E4 464 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SCGB1D4Q6XE38 83 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 LINC00173Q6ZV60 143 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FA2HQ7L5A8 372 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 LINC00596Q86U02 117 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 NAA40Q86UY6 237 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 LRP11Q86VZ4 500 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 GID4Q8IVV7 300 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TMEM183AQ8IXX5 376 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 GAPTQ8N292 157 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 DRAM1Q8N682 238 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 CLDN22Q8N7P3 220 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 DCAF4L2Q8NA75 395 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 GATD1Q8NB37 220 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 C11orf72Q8NBR9 251 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 MDS2Q8NDY4 140 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 PXT1Q8NFP0 134 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 GPR32P1Q8NGA4 272 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR10G2Q8NGC3 310 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR8A1Q8NGG7 326 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR2D3Q8NGH3 330 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR10G4Q8NGN3 311 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR4C13Q8NGP0 309 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR9A2Q8NGT5 310 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR5H2Q8NGV7 314 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR51H1Q8NH63 302 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 MCFD2Q8NI22 146 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 COQ8AQ8NI60 647 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 PIFOQ8TCI5 191 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 NEK7Q8TDX7 302 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 Q8WTZ3 238 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 C7orf33Q8WU49 177 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ORAOV1Q8WV07 137 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 RASSF5Q8WWW0 418 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 DEDD2Q8WXF8 326 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ASB13Q8WXK3 278 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 RDH5Q92781 318 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 PTX4Q96A99 478 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 CLDN23Q96B33 292 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 BORCS7Q96B45 105 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 PPCDCQ96CD2 204 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 LRRC58Q96CX6 371 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SMARCD1Q96GM5 515 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ACY3Q96HD9 319 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FMC1Q96HJ9 113 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SLC35E1Q96K37 410 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 KCNS1Q96KK3 526 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM210BQ96KR6 192 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 SLC35G5Q96KT7 338 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 BMFQ96LC9 184 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 FAM19A4Q96LR4 140 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 MBOAT7Q96N66 472 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR2M2Q96R28 347 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 OR4K3Q96R72 315 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TRIB3Q96RU7 358 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 ZNF382Q96SR6 550 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 TBL1YQ9BQ87 522 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-197P-201ENST00000516680 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms