RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515711.1

LMNA-224, Transcript of lamin A/C, human

TSL 5

Gene LMNA, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNA-224	ENST00000515711	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CD3E	P07766	207 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CD55	P08174	381 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	GSTT2	P0CG29	244 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CXCL3	P19876	107 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	GZMK	P49863	264 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	IL13RA1	P78552	427 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	GAPT	Q8N292	157 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.08	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FAM221A	A4D161	298 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	GOSR2	O14653	212 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SPRY3	O43610	288 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR2A4	O95047	310 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SFT2D2	O95562	160 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	AKR1C4	P17516	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TNFRSF1A	P19438	455 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	VAMP1	P23763	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PAX5	Q02548	391 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TESK1	Q15569	626 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FAM209A	Q5JX71	171 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711		Q8TCH9	128 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR2A7	Q96R45	310 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	HCFC1	P51610	2035 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711		M0R233	179 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SLC22A5	O76082	557 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR4A8	P0C604	315 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	HLA-G	P17693	338 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	AGA	P20933	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FCGR2C	P31995	323 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711		Q6ZPA2	131 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	WNT9B	O14905	357 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	PPY	P01298	95 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	IRF2	P14316	349 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	GNLY	P22749	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	DNASE1	P24855	282 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	FGL1	Q08830	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LMNA-224	ENST00000515711	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8

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