RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMM23	O14925	209 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYL12B	O14950	172 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	WIPF1	O43516	503 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSPAN15	O95858	294 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL1A	P01583	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINA2	P20848	420 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLP1R	P43220	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ3	P48549	501 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFHR4	Q92496	578 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUL1	Q969V5	352 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNAB3	O43448	404 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SC5D	O75845	299 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD24	P25063	80 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSTR5	P35346	364 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	BLCAP	P62952	87 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC35A2	P78381	396 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	VCX	Q9H320	206 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTGES3L	E9PB15	166 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QZ24	198 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	F2RL2	O00254	374 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAS1	P04201	325 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYF6	P23409	242 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	HERPUD1	Q15011	391 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP28	Q9H239	520 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP27	Q9H306	513 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP21	Q9H596	190 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSG11	Q9UQ72	335 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014		J3QR06	171 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT-ND4	P03905	459 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMY1A	P04745	511 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMY2A	P04746	511 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD37	P11049	281 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2F2	P13984	249 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFYB	P25208	207 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	VHL	P40337	213 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAPT	Q8N292	157 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	MND1	Q9BWT6	205 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	BANF2	Q9H503	90 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.15	□□□□□ -0.78

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