RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511080.5

FBXO38-217, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 4

Gene FBXO38, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-217	ENST00000511080	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080		M0R2N4	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	APOL3	O95236	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	GNAO1	P09471	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SLC2A1	P11166	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	DDOST	P39656	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	HCCS	P53701	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	LINC00205	P59089	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	UTF1	Q5T230	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TBX5	Q99593	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080		R4GMQ9	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080		J3QRE1	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PSMD9	O00233	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	HSPA12A	O43301	675 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	MMP23A	O75900	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ZNF85	Q03923	595 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ZNF92	Q03936	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	GALE	Q14376	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-217	ENST00000511080	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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