RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	HSD17B6	O14756	317 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ELANE	P08246	267 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302		Q8NFD4	153 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	RFK	Q969G6	155 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	POMP	Q9Y244	141 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A1W2PPE3	182 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	CCRL2	O00421	344 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	MPZL2	O60487	215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	HCK	P08631	526 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	HTR1A	P08908	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	CCR9	P51686	369 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZP1	P60852	638 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302		Q8N9W7	124 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	EME1	Q96AY2	570 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	GYG2	O15488	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	LY86	O95711	162 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	SSTR5	P35346	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	REG1B	P48304	166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	KISS1	Q15726	138 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302		Q8N6K4	173 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF691	Q5VV52	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	CIB1	Q99828	191 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC16A6	O15403	523 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	VDAC1	P21796	283 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	KCNJ3	P48549	501 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	PAX5	Q02548	391 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	FHL3	Q13643	280 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	IL13RA2	Q14627	380 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKDCC-208	ENST00000490302	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SULT1B1	O43704	296 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IGHG4	P01861	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	INSL3	P51460	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	CFHR3	Q02985	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	S1PR3	Q99500	378 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302		J3QLW9	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	MOS	P00540	346 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF19	P17023	458 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	FAS	P25445	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	CD1B	P29016	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	RNFT2	Q96EX2	444 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302		J3QRE1	110 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	GZMH	P20718	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	IL3RA	P26951	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PSMB8	P28062	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-208	ENST00000490302	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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