RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		V9GY05	133 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB3B	P20337	219 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNLT3	P51808	116 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB11B	Q15907	218 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGY	Q3MUY2	71 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6P435	159 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD7	Q96MP8	289 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF714	Q96N38	554 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM82	A0PJX8	343 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF3B	A8MYP8	253 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC17A2	O00624	439 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A1	O15245	554 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	BPNT1	O95861	308 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CSN2	P05814	226 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ARSB	P15848	533 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MGMT	P16455	207 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF273	Q14593	569 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM189A2	Q15884	450 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF626	Q68DY1	528 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	BRICD5	Q6PL45	260 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TPRA1	Q86W33	373 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK7	Q8TDX7	302 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CORO2A	Q92828	525 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PPA2	Q9H2U2	334 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT22	Q9H7X7	185 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	WIPF1	O43516	503 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PSPN	O60542	156 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL3L1	P16619	93 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR3A1	P47881	315 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RX3	P56373	397 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52W1	Q6IF63	320 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPD6	Q86Y78	171 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	BANF2	Q9H503	90 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRD5	423 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRF3	423 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PRM7	423 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BUX3	64 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MPIG6B	O95866	241 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	CD37	P11049	281 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DLX1	P56177	255 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PNKD	Q8N490	385 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PIFO	Q8TCI5	191 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51E2	Q9H255	320 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP27	Q9H306	513 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		14	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB6	O14558	160 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GLA	P06280	429 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT3	P21217	361 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	GADD45A	P24522	165 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	PAX5	Q02548	391 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	AES	Q08117	197 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.99	□□□□□ -0.17

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