RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 RETNQ9HD89 108 aa10.27□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 A0A087WUJ7 227 aa10.27□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF727A8MUV8 499 aa10.27□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 CCL2P13500 99 aa10.27□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 FOXF1Q12946 379 aa10.27□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-43DP0DP04 118 aa10.26□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 PPICP45877 212 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 OR3A4PP47883 348 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 PRSS12P56730 875 aa10.25□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 LAT2Q9GZY6 243 aa10.25□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 AMTP48728 403 aa10.25□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 OR4C3Q8NH37 302 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 S1PR5Q9H228 398 aa10.25□□□□□ -0.77
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CCBE1-202ENST00000439986 CLEC1BQ9P126 229 aa10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 TRDCB7Z8K6 153 aa10.24□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 ERVFC1-1P60608 527 aa10.24□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.24□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 FGF14Q92915 247 aa10.24□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 C4orf45Q96LM5 186 aa10.24□□□□□ -0.77
CCBE1-202ENST00000439986 C2orf50Q96LR7 162 aa10.24□□□□□ -0.77
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