RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 DOK5Q9P104 306 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SERPINE3A8MV23 424 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 BAXQ07812 192 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SSX2Q16385 188 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FDX2Q6P4F2 183 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MKXQ8IYA7 352 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 ATG101Q9BSB4 218 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GPR27Q9NS67 375 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 PLXNB1O43157 2135 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PR77 199 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MT-ND4LP03901 98 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FOLR3P41439 243 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OR6X1Q8NH79 312 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 AQP10Q96PS8 301 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CHST5Q9GZS9 411 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PQD3 144 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 AP4M1O00189 453 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FGF16O43320 207 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 NTF4P34130 210 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 PRDX4Q13162 271 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GAMTQ14353 236 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OR4F5Q8NH21 305 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OR4F4Q96R69 305 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 TNCP24821 2201 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 AQP7P3A6NL99 342 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MPPED1O15442 326 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 LILRA1O75019 489 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CD55P08174 381 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 THBS4P35443 961 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SCAND1P57086 179 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 RAB4BP61018 213 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.19□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 RHBDL1O75783 438 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SCGB1D1O95968 90 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SLC35B1P78383 322 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 Q8WTZ3 238 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 LHX4Q969G2 390 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GLRX2Q9NS18 164 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 LAMA5O15230 3695 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 A0A1B0GUS0 222 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PNV4 684 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OR8U8P0C7N1 319 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 S100GP29377 79 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 TMEM187Q14656 261 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 BTNL8Q6UX41 500 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 MVB12AQ96EY5 273 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CLN8Q9UBY8 286 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 STARD10Q9Y365 291 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 HSPB2A8KAH6 182 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 CD200P41217 278 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 GABRA2P47869 451 aa7.18□□□□□ -1.26
SNX13-201ENST00000409076 FABP6P51161 128 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms