RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 CDH26Q8IXH8 852 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 THRSPQ92748 146 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 ORAI1Q96D31 301 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 DERL3Q96Q80 235 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 COL7A1Q02388 2944 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 CD37P11049 281 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 OR14A2Q96R54 314 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 GLS2Q9UI32 602 aa9.86□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 SH2D1BO14796 132 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 TMEM225BP0DP42 221 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 DUSP1P28562 367 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 CEACAM3P40198 252 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 P2RX3P56373 397 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 OR52W1Q6IF63 320 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 ZNF596Q8TC21 504 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.85□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 M0QZK8 103 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 CD24P25063 80 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-11P60412 298 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-204ENST00000403441 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.84□□□□□ -0.83
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PRAME-204ENST00000403441 VSIG8P0DPA2 414 aa9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 LINC00596Q86U02 117 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 NKAIN3Q8N8D7 197 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 PHYHIPQ92561 330 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 CNBD2Q96M20 576 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 GPER1Q99527 375 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 B9D2Q9BPU9 175 aa9.83□□□□□ -0.84
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