RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395727.6

PTPN20-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN20, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN20-208	ENST00000395727	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A1W2PRD5	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A1W2PRF3	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A1W2PRM7	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A6NDX4	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GPX5	O75715	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	INMT	O95050	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ALDOB	P05062	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ARG1	P05089	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CD2	P06729	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OCM2	P0CE71	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CGB3	P0DN86	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CGB7	P0DN87	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GABRR1	P24046	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	COX7A1	P24310	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	POU3F4	P49335	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	BDH1	Q02338	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	IL18R1	Q13478	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KISS1	Q15726	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		Q6P435	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		Q6ZPA2	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		Q6ZTK2	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A0G2JK05	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ODAM	A1E959	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		E9PI62	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		H3BSH0	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727		H3BUI4	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GABRP	O00591	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	OGG1	O15527	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KCNAB3	O43448	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RAB3A	P20336	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	HTR1D	P28221	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CEACAM3	P40198	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PTGFR	P43088	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SSX2	Q16385	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	COQ2	Q96H96	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN20-208	ENST00000395727	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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