RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 IGLV1-47P01700 117 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MYF6P23409 242 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 EFNB2P52799 333 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PAX5Q02548 391 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR176Q14439 515 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SPHARQ15513 63 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MPV17LQ2QL34 196 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 KIRREL1Q96J84 757 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 VCX3BQ9H321 246 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.29■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A087X0M5 115 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1B0GX30 115 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 LEUTXA8MZ59 168 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 M0QZ24 198 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 IL1AP01583 271 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 PRRX1P54821 245 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC35A2P78381 396 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 INSL4Q14641 139 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MED22Q15528 200 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 AWAT2Q6E213 333 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 CDH26Q8IXH8 852 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TMED9Q9BVK6 235 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa16.28■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 H0YHG0 523 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 IRF3Q14653 427 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 LTC4SQ16873 150 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 NKAIN3Q8N8D7 197 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 OR9G1Q8NH87 305 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 RFESDQ8TAC1 157 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 NEK7Q8TDX7 302 aa16.27■□□□□ 0.2
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHV3-7P01780 117 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 SSTR5P35346 364 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf88Q6PI97 169 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LYPD6Q86Y78 171 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 DTX3Q8N9I9 347 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LEAP2Q969E1 77 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 BANF2Q9H503 90 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 DUSP21Q9H596 190 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF702PQ9H963 129 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.26■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM90A22PA8MWA6 464 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CD24P25063 80 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 BRS3P32247 399 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CEACAM3P40198 252 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 UQCC2Q9BRT2 126 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP28Q9H239 520 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LY6LH3BQJ8 138 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS10O43665 173 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MGMTP16455 207 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGDIBP52566 201 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 GP2P55259 537 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HERPUD1Q15011 391 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM104Q8NE00 496 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC107Q8WV48 283 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 UFD1Q92890 307 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 PRSS22Q9GZN4 317 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 MCRIP1C9JLW8 97 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BUI4 141 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 J3QR06 171 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HSMCR30P0CW71 290 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CRHBPP24387 322 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 HSPA13P48723 471 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 GNG10P50151 68 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR50Q13585 617 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB12Q6IQ22 244 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZTK2 550 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 Q8N2B8 174 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms