RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01006Q8NI28 216 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NDNFQ8TB73 568 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 UFD1Q92890 307 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CST11Q9H112 138 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF25Q9UIL4 384 aa6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TIMM23O14925 209 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PIN1P1O15428 100 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ORC5O43913 435 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ARL6IP5O75915 188 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 IL1AP01583 271 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV1-47P01700 117 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MAS1P04201 325 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SRMP19623 302 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINA2P20848 420 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 FUT3P21217 361 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GABRA5P31644 462 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMD7P51665 324 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM189A2Q15884 450 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SSX2Q16385 188 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PIGYQ3MUY2 71 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 Q3ZCU0 254 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PRR31Q5SQ13 230 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 AWAT2Q6E213 333 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZSV7 163 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR9G1Q8NH87 305 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NEK7Q8TDX7 302 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 C17orf50Q8WW18 174 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MUL1Q969V5 352 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ORAI1Q96D31 301 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CALYQ9NYX4 217 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 NOTCH1P46531 2555 aa6.88□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PPK0 400 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 M0QZ24 198 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 F2RL2O00254 374 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 SC5DO75845 299 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V1G2O95670 118 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 BPNT1O95861 308 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 UCHL1P09936 223 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CD37P11049 281 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MGMTP16455 207 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CPEP16870 476 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MNDAP41218 407 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 GLP1RP43220 463 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PROK1P58294 105 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LY6EQ16553 131 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 LYPD6Q86Y78 171 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PIFOQ8TCI5 191 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 KIRREL1Q96J84 757 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5M11Q96RB7 305 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 MGLLQ99685 303 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CITED1Q99966 193 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TMED9Q9BVK6 235 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 ING3Q9NXR8 418 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MT-TS1-201ENST00000387416 TCF19Q9Y242 345 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms