RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 RPRMQ9NS64 109 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 NAT8Q9UHE5 227 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 WASF3Q9UPY6 502 aa9.71□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PNR3 127 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 IFNA5P01569 189 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 IGKV1D-12P01611 117 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TCN2P20062 427 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 CCKARP32238 428 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 SERF2P84101 59 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF154Q13106 437 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PRDX4Q13162 271 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF787Q6DD87 383 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TMEM123Q8N131 208 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 Q8NFD4 153 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 DYRK2Q92630 601 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 R3HDM4Q96D70 268 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 LRFN1Q9P244 771 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PPC4 97 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM221AA4D161 298 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A10PA6NDY2 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A7PA6NKC0 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A12PA8MX19 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PPP5D1E7EU14 171 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 CYTIPO60759 359 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TUSC2O75896 110 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TYMSP04818 313 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 WNT2P09544 360 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 SFTPCP11686 197 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF726P1Q15940 193 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 MPV17LQ2QL34 196 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PIGYQ3MUY2 71 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 OR2M3Q8NG83 312 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 BORCS8Q96FH0 119 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 RAB40CQ96S21 281 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.7□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 XKRY2A2RUG3 117 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 H0Y980 276 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 EREGO14944 169 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 IFNA1P01562 189 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 COX5BP10606 129 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 CLDN17P56750 224 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 CLN3Q13286 438 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 IQCJQ1A5X6 159 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FAM27BQ5VT28 67 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 BADQ92934 168 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TECTBQ96PL2 329 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.69□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ZFP92A6NM28 416 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TMEM250H0YL14 139 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 DHHO43323 396 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 APLNRP35414 380 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 FUT6P51993 359 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 NUBP1P53384 320 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.68□□□□□ -0.86
GINS3-202ENST00000328514 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms