RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 PP6455Q8WZ26 134 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 AICDAQ9GZX7 198 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 RFNGQ9Y644 331 aa14.54□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GU03 582 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 SNURFLB1AK76 121 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 TRDCB7Z8K6 153 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 H3BMH7 237 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 DCAF10Q5QP82 559 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 FDX2Q6P4F2 183 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MVB12AQ96EY5 273 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 PLPP3O14495 311 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 RLN3Q8WXF3 142 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 BOD1Q96IK1 185 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 DIRC2Q96SL1 478 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 RPRMQ9NS64 109 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 H0Y8X5 98 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 TEX38Q6PEX7 206 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 ATOH7Q8N100 152 aa14.53□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 IGSF23A1L1A6 192 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 LDLRAD4O15165 306 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 CBR3O75828 277 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 Q5PR19 223 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 LIPHQ8WWY8 451 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 COX14Q96I36 57 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 LYPD3O95274 346 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 MMDQ15546 238 aa14.52□□□□□ -0.08
PACS1-201ENST00000320580 PPYP01298 95 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM50BP56557 158 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ERGP11308 486 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CD33P20138 364 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 GPHA2Q96T91 129 aa14.52□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 BLACEA4D250 179 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RUNX3Q13761 415 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TIGITQ495A1 244 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 PARLQ9H300 379 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 M0R1X1 148 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 FOXK1P85037 733 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RDH5Q92781 318 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 P2RX4Q99571 388 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 MPDZO75970 2070 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM210A6NLX4 147 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 HS3ST1O14792 307 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 GCH1P30793 250 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 Q56UQ5 140 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 Q6ZSR6 202 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 NAT6Q93015 286 aa14.51□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM187Q14656 261 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF77Q15935 545 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CYR61O00622 381 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SYNGR2O43760 224 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 TCL1AP56279 114 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 GAPTQ8N292 157 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 CTXN2P0C2S0 81 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 BGLAPP02818 100 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 BRS3P32247 399 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 EDDM3BP56851 147 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.5□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 KBTBD11O94819 623 aa14.49□□□□□ -0.09
PACS1-201ENST00000320580 SYNGR4O95473 234 aa14.49□□□□□ -0.09
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