RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ADH4P08319 380 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF2P14316 349 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PGAM2P15259 253 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN54Q6MZP7 749 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 DECR2Q9NUI1 292 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 FRYQ5TBA9 3013 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SRRM5B3KS81 715 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 B9A039 149 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 SNAPC5O75971 98 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A5O76082 557 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN14O95500 239 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LHBP01229 141 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CD55P08174 381 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF728P0DKX0 622 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 FCGR2CP31995 323 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDX2P32119 198 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS2Q13268 280 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM209AQ5JX71 171 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LYG2Q86SG7 212 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 NOXA1Q86UR1 476 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8TCH9 128 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PHB2Q99623 299 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 GCM1Q9NP62 436 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 E7EQL1 145 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 HERV-K104P61576 105 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TLE1Q04724 770 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TESK1Q15569 626 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 GAPTQ8N292 157 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB13Q8WXK3 278 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CYYR1Q96J86 154 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.5□□□□□ -1.05
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RABGGTB-201ENST00000319942 SCTP09683 121 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG2P11465 335 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL3P19876 107 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 GNLYP22749 145 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB25P24278 435 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CD34P28906 385 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRA2P47869 451 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL8P80075 99 aa8.49□□□□□ -1.05
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