RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 PCSK4Q6UW60 755 aa16.9■□□□□ 0.3
UBXN6-201ENST00000301281 ACP7Q6ZNF0 438 aa16.9■□□□□ 0.3
UBXN6-201ENST00000301281 TMUB2Q71RG4 321 aa16.9■□□□□ 0.3
UBXN6-201ENST00000301281 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.9■□□□□ 0.3
UBXN6-201ENST00000301281 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.9■□□□□ 0.3
UBXN6-201ENST00000301281 DLL1O00548 723 aa16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 C4BPBP20851 252 aa16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 GALNT14Q96FL9 552 aa16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 OR10C1Q96KK4 312 aa16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MFFQ9GZY8 342 aa16.89■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 PSPNO60542 156 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 CTXN2P0C2S0 81 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 KCNJ3P48549 501 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF546Q86UE3 836 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 DMRTA2Q96SC8 542 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 CABLES2Q9BTV7 478 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 ARL6Q9H0F7 186 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TNFSF18Q9UNG2 199 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 DIRAS3O95661 229 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 HOXB5P09067 269 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 OR5AC1P0C628 307 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MZT1Q08AG7 82 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MOB1BQ7L9L4 216 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 POM121CA8CG34 1229 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 THBDP07204 575 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 IGKV1-13P0DP09 117 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 LMO1P25800 156 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 GNRHRP30968 328 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM187Q14656 261 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 KIRREL1Q96J84 757 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MBD2Q9UBB5 411 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 KALRNO60229 2985 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 NBEAQ8NFP9 2946 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 H7C1Q1 480 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TFF1P04155 84 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 C1QTNF9P0C862 333 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 PSMB6P28072 239 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SMIM21Q3B7S5 101 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SP6Q3SY56 376 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SPRNQ5BIV9 151 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 WFDC8Q8IUA0 241 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 LRRC29Q8WV35 223 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 VKORC1Q9BQB6 163 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 RNF222A6NCQ9 220 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 EGR1P18146 543 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 RND1Q92730 232 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 OR2V2Q96R30 315 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 POLEQ07864 2286 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 CACNA1AO00555 2505 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 RP2O75695 350 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 KLRB1Q12918 225 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 IL15RAQ13261 267 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF345Q14585 488 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM108Q6UXF1 575 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 NUP37Q8NFH4 326 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 PRR7Q8TB68 274 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 THAP6Q8TBB0 222 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 C2orf50Q96LR7 162 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 H0YIZ8 118 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 IFNA7P01567 189 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 FAM219AQ8IW50 185 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 OR1A1Q9P1Q5 309 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 GLS2Q9UI32 602 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 METRNQ9UJH8 293 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 MEMO1Q9Y316 297 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SRRM5B3KS81 715 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN6-201ENST00000301281 SPRY3O43610 288 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms