RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 AUP1Q9Y679 476 aa9.29□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SCTP09683 121 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 S100PP25815 95 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 CA7P43166 264 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PPP1R1AQ13522 171 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 LRP5LA4QPB2 252 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DEGS1O15121 323 aa9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 KCTD9Q7L273 389 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.28□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 GOSR2O14653 212 aa9.27□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 OR2H2O95918 312 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR5H8P0DN80 308 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PGAM2P15259 253 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 EGR1P18146 543 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 GZMKP49863 264 aa9.27□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 WDR82Q6UXN9 313 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 TERB2Q8NHR7 220 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 PRRT1Q99946 306 aa9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
GGPS1-201ENST00000282841 OR51M1Q9H341 326 aa9.27□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 JKAMPQ9P055 326 aa9.27□□□□□ -0.92
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GGPS1-201ENST00000282841 SEC22AQ96IW7 307 aa9.27□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 H7C2Y5 167 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 KITLGP21583 273 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 MPZP25189 248 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 GLRXP35754 106 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGPS1-201ENST00000282841 FCGR2CP31995 323 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 Q6P435 159 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.26□□□□□ -0.93
GGPS1-201ENST00000282841 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.26□□□□□ -0.93
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