RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	CD40	P25942	277 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	GMFB	P60983	142 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	MEMO1	Q9Y316	297 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1B0GWJ7	208 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	HS3ST1	O14792	307 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	NAPSA	O96009	420 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	FPR2	P25090	351 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	BVES	Q8NE79	360 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	RDH5	Q92781	318 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	LIME1	Q9H400	295 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ATRX	P46100	2492 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	POLE	Q07864	2286 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	OR2A4	O95047	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SIX6	O95475	246 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	PI3	P19957	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	H2BFS	P57053	126 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	RAP2B	P61225	183 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	MPPED2	Q15777	294 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	C9orf170	A2RU37	121 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	GOSR2	O14653	212 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	NXPH2	O95156	264 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF205	O95201	554 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280		Q6P435	159 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	PRORY	Q9H606	182 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280		A6NLC8	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	DEGS1	O15121	323 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF44	P15621	663 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	VAMP1	P23763	118 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	S100A11	P31949	105 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	CASP6	P55212	293 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	IL13RA1	P78552	427 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	THBD	P07204	575 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TAS2R31	P59538	309 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280		Q9N2K0	584 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	RP2	O75695	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	GLRA1	P23415	457 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	CD34	P28906	385 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	CA7	P43166	264 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF146	Q15072	292 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	WNT9B	O14905	357 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	OR2H2	O95918	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	GLA	P06280	429 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DNM1-222	ENST00000636280	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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