RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PSME3-215	ENST00000592578	F2RL2	O00254	374 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CD28	P10747	220 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	MYL12A	P19105	171 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CDK2	P24941	298 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PTGFR	P43088	359 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ETV1	P50549	477 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	MED21	Q13503	144 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578		Q8N2B8	174 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	COQ2	Q96H96	371 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578		H0YJX3	145 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	GABRP	O00591	440 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ALDOB	P05062	364 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PPP3R1	P63098	170 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	BDH1	Q02338	343 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	RSU1	Q15404	277 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578		U3KQK5	164 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TOR1A	O14656	332 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OGG1	O15527	345 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CD34	P28906	385 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	BRS3	P32247	399 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PRRX1	P54821	245 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	SMIM19	Q96E16	107 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578		A0A087X0M5	115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1B0GX30	115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	HSPB6	O14558	160 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	HTR3B	O95264	441 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CEACAM3	P40198	252 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	KCNJ3	P48549	501 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578		Q8NFD4	153 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM80	Q96HE8	168 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	S100A13	Q99584	98 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME3-215	ENST00000592578	BDKRB2	P30411	391 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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