RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-215ENST00000546102 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 A0A1W2PPE3 182 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 METTL15A6NJ78 407 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TMEM212A6NML5 194 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZNF879B4DU55 563 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 J3QLW9 94 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 J3QRE1 110 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 K7EQD1 137 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 GPR171O14626 319 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 RS1O15537 224 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 BUB3O43684 328 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SULT1C4O75897 302 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ARL6IP5O75915 188 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CLPXO76031 633 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 AQP8O94778 261 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZNF432O94892 652 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 IGHG3P01860 377 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 PRSS1P07477 247 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 FCGR3AP08637 254 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 PGA4P0DJD7 388 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 PGA3P0DJD8 388 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZNF823P16415 610 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZNF19P17023 458 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CELP19835 753 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CFL1P23528 166 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 MYL9P24844 172 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CD1BP29016 333 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SHC1P29353 583 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 PYCR1P32322 319 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 S100A5P33763 92 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 UGT2B10P36537 528 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CRYBB2P43320 205 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CSNK1A1P48729 337 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TGM4P49221 684 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 STARP49675 285 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 P2RY4P51582 365 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LINC00205P59089 165 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ERVK-16P61578 105 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 VBP1P61758 197 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 NCS1P62166 190 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 MAB21L1Q13394 359 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TPBGQ13641 420 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LAGE3Q14657 143 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SPCS2Q15005 226 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CDK5R1Q15078 307 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 STK11Q15831 433 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SSX1Q16384 188 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 BCL2A1Q16548 175 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LCE1EQ5T753 118 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR2G6Q5TZ20 316 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SPSB3Q6PJ21 355 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 IGFL2Q6UWQ7 119 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CDC20BQ86Y33 519 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 IQCF2Q8IXL9 164 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR6V1Q8N148 313 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 BPIFB2Q8N4F0 458 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZADH2Q8N4Q0 377 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TMEM251Q8N6I4 163 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 KIR3DL3Q8N743 410 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 YIPF7Q8N8F6 280 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 FDCSPQ8NFU4 85 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR4C5Q8NGB2 326 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR51L1Q8NGJ5 315 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR10G7Q8NGN6 311 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR6N1Q8NGY5 312 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OR10D3Q8NH80 312 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 OTOSQ8NHW6 89 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 NEIL3Q8TAT5 605 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 NDNFQ8TB73 568 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ZPLD1Q8TCW7 415 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SMIM19Q96E16 107 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 FAHD2AQ96GK7 314 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 KCTD7Q96MP8 289 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 TMED9Q9BVK6 235 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 CLEC7AQ9BXN2 247 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 HES7Q9BYE0 225 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 MROQ9BYG7 248 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 ULBP2Q9BZM5 246 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 DCSTAMPQ9H295 470 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.85□□□□□ -1.95
CUL3-215ENST00000546102 SIAEQ9HAT2 523 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms