RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.56■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 H3BUX3 64 aa15.56■□□□□ 0.08
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CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF626Q68DY1 528 aa15.53■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.53■□□□□ 0.08
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CD27-AS1-208ENST00000538616 OR11H6Q8NGC7 330 aa15.53■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.53■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 FUOMA2VDF0 154 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSN2P05814 226 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 CD1AP06126 327 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB13P51153 203 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 MED22Q15528 200 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 OSR2Q8N2R0 312 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 DTX3Q8N9I9 347 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 CORO2AQ92828 525 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUL1Q969V5 352 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 S100A13Q99584 98 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM133Q9H2Q1 129 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 VCX3BQ9H321 246 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15.52■□□□□ 0.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL7A1Q02388 2944 aa15.52■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa15.51■□□□□ 0.07
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CD27-AS1-208ENST00000538616 MPIG6BO95866 241 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK2P24941 298 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM11P57052 281 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 BDH1Q02338 343 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRF3Q14653 427 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPHARQ15513 63 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSX2Q16385 188 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM27D1Q5T7N8 215 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIFOQ8TCI5 191 aa15.51■□□□□ 0.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNBD2Q96M20 576 aa15.51■□□□□ 0.07
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