RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 DNASE1L1P49184 302 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TLE4Q04727 773 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LYPD6Q86Y78 171 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 HAS2Q92819 552 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FRG2CA6NGY1 282 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CCL25O15444 150 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SOCS1O15524 211 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CELA2AP08217 269 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CT62P0C5K7 136 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GLI4P10075 376 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TUBG1P23258 451 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RND2P52198 227 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MFAP5Q13361 173 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OTOSQ8NHW6 89 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OR8B4Q96RC9 309 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 NXPH2O95156 264 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RNF151Q2KHN1 245 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FREM3P0C091 2139 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GU03 582 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 UTS2O95399 124 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 VHLLQ6RSH7 139 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM123Q8N131 208 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SDSLQ96GA7 329 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RASL10BQ96S79 203 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 VAX2Q9UIW0 290 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PP11 408 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FAM166BA8MTA8 275 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GZMHP20718 246 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 QRFPP83859 136 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FUT7Q11130 342 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SP6Q3SY56 376 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ALG10Q5BKT4 473 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 AK3Q9UIJ7 227 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 NBASA2RRP1 2371 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SDK2Q58EX2 2172 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS47A8MTI9 375 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ITGB1BP1O14713 200 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-16P01601 117 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ERVS71-1P61550 626 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RAB11AP62491 216 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM2Q9C040 744 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 DKK4Q9UBT3 224 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 MLF1P58340 268 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 VAMP2P63027 116 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 TBR1Q16650 682 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FHL5Q5TD97 284 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 SPINK14Q6IE38 97 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZVH6 145 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LHFPL1Q86WI0 220 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 BCORP1Q8N888 145 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1456Q9P272 454 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 VDAC3Q9Y277 283 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 HRKO00198 91 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 FSTP19883 344 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V0CP27449 155 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN1BP46527 198 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-211ENST00000520276 RAB7AP51149 207 aa8.75□□□□□ -1.01
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