RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2A4O95047 310 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGF4P08620 206 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NQO1P15559 274 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF137PP52743 207 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFNA4P52798 201 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBX1P83916 185 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 APOFQ13790 326 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSMD5Q16401 504 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM241Q24JQ0 296 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTC23Q5W5X9 447 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 STEAP4Q687X5 459 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 DCXRQ7Z4W1 244 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBLN2Q8IUK8 224 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYB561A3Q8NBI2 242 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR10W1Q8NGF6 305 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD200R1Q8TD46 325 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 RXFP2Q8WXD0 754 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAMM41Q96BW9 452 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMARCD1Q96GM5 515 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CABS1Q96KC9 395 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2A7Q96R45 310 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP5SQ99766 215 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARV1Q9H2C2 271 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRABDQ9H4I3 376 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMDT1Q9H4I9 107 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC35D1Q9NTN3 355 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUMA1Q14980 2115 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 MIA3Q5JRA6 1907 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM235A6NFC5 223 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 H3BPC8 53 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2T1O43869 369 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 COX7A2P2O60397 106 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC16A7O60669 478 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEC22BO75396 215 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SERPINA3P01011 423 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4A8P0C604 315 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP6V1C1P21283 382 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD200P41217 278 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLTPP55058 493 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACTR1AP61163 376 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 QRFPP83859 136 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1Q1Q15612 314 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSX1Q16384 188 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 MOGQ16653 247 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 USH1GQ495M9 461 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 HSP90B2PQ58FF3 399 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 C6orf52Q5T4I8 152 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CERS6Q6ZMG9 384 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CMC1Q7Z7K0 106 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 HORMAD1Q86X24 394 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5J2Q8NH18 312 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4C6Q8NH72 309 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUBPLQ8TB37 319 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR151Q8TDV0 419 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ECHDC3Q96DC8 303 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CMBLQ96DG6 245 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SGTBQ96EQ0 304 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SENP8Q96LD8 212 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRRC1Q96M27 445 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 HBEGFQ99075 208 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR21Q99679 349 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 UQCC2Q9BRT2 126 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 THAP9Q9H5L6 903 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 NT5MQ9NPB1 228 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCNIP2Q9NS61 270 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMCC3Q9ULS5 477 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPIL1Q9Y3C6 166 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR19Q8NEZ3 1342 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 K7EIL1 84 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 M0R3G1 203 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 UPK1AO00322 258 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABRPO00591 440 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC22A1O15245 554 aa-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms