RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	RDH12	Q96NR8	316 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	RETN	Q9HD89	108 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276		A6NIN4	97 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	IFNG	P01579	166 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF3	P17036	446 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	NFYB	P25208	207 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	GLIPR1	P48060	266 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	SLURP1	P55000	103 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	ISL1	P61371	349 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	EBI3	Q14213	229 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	OTULIN	Q96BN8	352 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	KCTD7	Q96MP8	289 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	FEV	Q99581	238 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.21	□□□□□ -0.77
FAM53C-208	ENST00000511276		J3QR06	171 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPA12A	O43301	675 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	MPZL2	O60487	215 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ARSB	P15848	533 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	PRKACG	P22612	351 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	PTGFR	P43088	359 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPA13	P48723	471 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB7A	P51149	207 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	DAP	P51397	102 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	AES	Q08117	197 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	KMT2A	Q03164	3969 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	GAST	P01350	101 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	TTR	P02766	147 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276		Q8N6K4	173 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276		V9GYS6	101 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	C12orf77	C9JDV5	145 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	SIRPB1	O00241	398 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	SOX14	O95416	240 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	IGF1	P05019	195 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	CALCB	P10092	127 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ALOX5AP	P20292	161 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	HCCS	P53701	268 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	AQP4	P55087	323 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ZP1	P60852	638 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF146	Q15072	292 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FAM53C-208	ENST00000511276	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78

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