RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GABRP	O00591	440 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CYB5A	P00167	134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	MAS1	P04201	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	UCHL1	P09936	223 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PGA5	P0DJD9	388 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SRM	P19623	302 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	AMY2B	P19961	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	POU3F4	P49335	361 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	MUL1	Q969V5	352 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF488	Q96MN9	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GPER1	Q99527	375 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TFF1	P04155	84 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFB7	P17568	137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CD83	Q01151	205 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NXPH2	O95156	264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GAL	P22466	123 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ZP1	P60852	638 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DGUOK	Q16854	277 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	STUM	Q69YW2	141 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	DPF1	Q92782	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	HES4	Q9HCC6	221 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NLK	Q9UBE8	527 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344		F8VVB4	439 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344		F8VWA3	439 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	CD36	P16671	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	BCL3	P20749	454 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PTGFR	P43088	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NPBWR2	P48146	333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	RAB13	P51153	203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344		Q6ZS46	218 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344		Q8IYB0	196 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	PXT1	Q8NFP0	134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	GAFA1	Q96PS6	74 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	ING4	Q9UNL4	249 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-208	ENST00000489344	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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