RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		F5H5P2	479 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		K7EM74	188 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LYZL6	O75951	148 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	AGFG2	O95081	481 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DIRAS3	O95661	229 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PMP2	P02689	132 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RLN1	P04808	185 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	WNT2	P09544	360 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRR1	P24046	479 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HAAO	P46952	286 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NPBWR2	P48146	333 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GPM6A	P51674	278 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	UCN	P55089	124 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8NA96	180 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	EXTL1	Q92935	676 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SFT2D2	O95562	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CECR9	P0C854	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A4	P12235	298 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	RPA2	P15927	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	BCL3	P20749	454 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C4BPB	P20851	252 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CCNO	P22674	350 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFSF4	P23510	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CD34	P28906	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OPRM1	P35372	400 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CFHR2	P36980	270 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR3A3	P47888	321 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PAX5	Q02548	391 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	FGL1	Q08830	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	PSG7	Q13046	419 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	IL15RA	Q13261	267 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF146	Q15072	292 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6P435	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZPA2	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZRM9	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ATG4A-208	ENST00000489247	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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