RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485939.5

BBX-225, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-225	ENST00000485939	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GP9	P14770	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CCL1	P22362	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SSTR5	P35346	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MNDA	P41218	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC35B1	P78383	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CDK5	Q00535	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MS4A2	Q01362	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FOXE3	Q13461	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZNF146	Q15072	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CORO2A	Q92828	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	REEP1	Q9H902	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939		A0A087X0M5	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939		A0A1B0GX30	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	AP4M1	O00189	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CCRL2	O00421	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	HSD17B6	O14756	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	FGF16	O43320	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SAP30	O75446	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGHG4	P01861	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZNF44	P15621	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MYF6	P23409	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CNTFR	P26992	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PSMB8	P28062	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	EPHA2	P29317	976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC6A1	P30531	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CEACAM3	P40198	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	F2RL1	P55085	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	NDP	Q00604	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939		Q8N1Y9	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	GIPC3	Q8TF64	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBX-225	ENST00000485939	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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