RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ALG12Q9BV10 488 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 BANF2Q9H503 90 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 DHDHQ9UQ10 334 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 WDR45Q9Y484 360 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 EYSQ5T1H1 3165 aa6.23□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 H0Y8G0 127 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 H7BYZ3 331 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CORTO00230 105 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SIRPB1O00241 398 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 COCHO43405 550 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FGF17O60258 216 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PSPNO60542 156 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 GOSR1O95249 250 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CDS2O95674 445 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CSTAP01040 98 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SLC35E2P0CK97 266 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 IGLC2P0DOY2 106 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 IGLC3P0DOY3 106 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 BCL2P10415 239 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ALOX5APP20292 161 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ANOS1P23352 680 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 DUSP1P28562 367 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 GCH1P30793 250 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 Q0VG73 95 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SCGB2A2Q13296 93 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 GNMTQ14749 295 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TXNDC8Q6A555 127 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TMEM156Q8N614 296 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 TOMM40LQ969M1 308 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SPSB1Q96BD6 273 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 Q96M85 177 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 RARRES2Q99969 163 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 CD84Q9UIB8 345 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 AK3Q9UIJ7 227 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.22□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.21□□□□□ -1.41
PKP4-211ENST00000481115 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SERPINE3A8MV23 424 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MSTNO14793 375 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 NDUFS4O43181 175 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ADAM20O43506 726 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 KBTBD11O94819 623 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CER1O95813 267 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HLA-HP01893 362 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 STAG3L3P0CL85 134 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HOXB2P14652 356 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GABRA3P34903 492 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GALR1P47211 349 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 CSNK1G2P78368 415 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 BTN3A2P78410 334 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 QRFPP83859 136 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SERF2P84101 59 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 ZNF550Q7Z398 422 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 NIT1Q86X76 327 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.21□□□□□ -1.42
PKP4-211ENST00000481115 STPG4Q8N801 248 aa6.21□□□□□ -1.42
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