RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS2R46	P59540	309 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	COL10A1	Q03692	680 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	MEF2D	Q14814	521 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	GRK1	Q15835	563 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	POC5	Q8NA72	575 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529		Q9N2K0	584 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	COPZ2	Q9P299	210 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TRAF4-208	ENST00000469529	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.65	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	FCGR3A	P08637	254 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	DAO	P14920	347 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR3A1	P47881	315 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	RFX2	P48378	723 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMYND11	Q15326	602 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	PLA1A	Q53H76	456 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	BEST4	Q8NFU0	473 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	APC	P25054	2843 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	SIRPB1	O00241	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR37	O15354	613 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB3D	O95716	219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	TK1	P04183	234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CD3D	P04234	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	GZMH	P20718	246 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	GIF	P27352	417 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	BTC	P35070	178 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR2DS4	P43632	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	BTG1	P62324	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	IL13RA1	P78552	427 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZNX1	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZPA2	131 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4K15	Q8NH41	348 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	DYRK2	Q92630	601 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB1C	Q92928	201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	FBN2	P35556	2912 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	LRBA	P50851	2863 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CD80	P33681	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	RAG2	P55895	527 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	GMFB	P60983	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CORO2A	Q92828	525 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	COQ2	Q96H96	371 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	CYYR1	Q96J86	154 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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