RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 ASB7Q9H672 318 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 COMMD9Q9P000 198 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB22AQ9UL26 194 aa3.56□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 DMDP11532 3685 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CIB4A0PJX0 185 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TAAR5O14804 337 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 UGT2B11O75310 529 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXH1O75593 365 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PTHP01270 115 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CSF3P09919 207 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 WARSP23381 471 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 MTPNP58546 118 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 S100A12P80511 92 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 LEMD1Q68G75 181 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 LYG2Q86SG7 212 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 COMMD7Q86VX2 200 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PPCDCQ96CD2 204 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RDH12Q96NR8 316 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 VNN3Q9NY84 501 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB26Q9ULW5 256 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A15Q9Y619 301 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CACNG2Q9Y698 323 aa3.55□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 USP24Q9UPU5 2620 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SOX14O95416 240 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SSTR5P35346 364 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM33P57088 247 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 BAXQ07812 192 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 MAPK14Q16539 360 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 PEX26Q7Z412 305 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 LGI3Q8N145 548 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 STK40Q8N2I9 435 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 BLNKQ8WV28 456 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF597Q96LX8 424 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RILPQ96NA2 401 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBP1Q9H171 429 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXL15Q9H469 300 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.841e-12■■■■□ 21.1
RABGGTB-204ENST00000461653 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SPEF2Q9C093 1822 aa3.54□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf74A8MZ97 194 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CA11O75493 328 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 UPK1BO75841 260 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 HPNP05981 417 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ERGP11308 486 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 CBR1P16152 277 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ADORA1P30542 326 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF235Q14590 738 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIQKQ629K1 86 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC51BQ86UW2 128 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-204ENST00000461653 GATD1Q8NB37 220 aa3.53□□□□□ -1.84
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