RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460752.1

FRA10AC1-202, Transcript of FRA10A associated CGG repeat 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FRA10AC1, Length 4,780 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRA10AC1-202ENST00000460752 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 AGTRAPQ6RW13 159 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ASCL4Q6XD76 172 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TEX29Q8N6K0 151 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZNF676Q8N7Q3 588 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 HSPB9Q9BQS6 159 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 NDFIP1Q9BT67 221 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 CST11Q9H112 138 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 FAM206AQ9NX38 181 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 GPR132Q9UNW8 380 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 FUT9Q9Y231 359 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ETV7Q9Y603 341 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PIK3C2AO00443 1686 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 DEPDC5O75140 1603 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TMEM213A2RRL7 107 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OOEPA6NGQ2 149 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR2T8A6NH00 312 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 CTDSPLO15194 276 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ERI3O43414 337 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 FOXS1O43638 330 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 FCGR3AP08637 254 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 GPX2P18283 190 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TSPOP30536 169 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 GLRXP35754 106 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PDX1P52945 283 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 FOXA1P55317 472 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SLC35A1P78382 337 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 NTHL1P78549 312 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PSG9Q00887 426 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PDE7AQ13946 482 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZNF485Q8NCK3 441 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PROKR1Q8TCW9 393 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ABHD6Q9BV23 337 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 RHOJQ9H4E5 214 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 RDH14Q9HBH5 336 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PIGVQ9NUD9 493 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SIGLEC7Q9Y286 467 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 HES2Q9Y543 173 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 VWDEQ8N2E2 1590 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 C7orf71A4D174 169 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TLCD2A6NGC4 264 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 NPIPB7O75200 414 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 JTBO76095 146 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 DBIP07108 87 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 C1QTNF9P0C862 333 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 HOXC9P31274 260 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ATP1B3P54709 279 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 RHOBP62745 196 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TGFBR3Q03167 851 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZNF415Q09FC8 603 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 MYBPHQ13203 477 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 STUMQ69YW2 141 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SLC18B1Q6NT16 456 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 DHRS13Q6UX07 377 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 BTNL8Q6UX41 500 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PRR22Q8IZ63 422 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 GATSQ8NAP1 163 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 OR10G9Q8NGN4 311 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 NRGNQ92686 78 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 LHX4Q969G2 390 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 PIGTQ969N2 578 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SARAFQ96BY9 339 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SPATA33Q96N06 139 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TSSK2Q96PF2 358 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 GABRG3Q99928 467 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SLC17A9Q9BYT1 436 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TMEM126AQ9H061 195 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.84□□□□□ -1.95
FRA10AC1-202ENST00000460752 TSPAN11A1L157 253 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms