RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	FUT6	P51993	359 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	IL24	Q13007	206 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR107	Q5VW38	600 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SPSB1	Q96BD6	273 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PKIB	Q9C010	78 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028		G3V4G9	280 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028		K7N7A8	449 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PEX14	O75381	377 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SC5D	O75845	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CHRM2	P08172	466 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	BDKRB2	P30411	391 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ATP1B3	P54709	279 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF273	Q14593	569 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FBLN7	Q53RD9	439 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SATL1	Q86VE3	508 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	MALSU1	Q96EH3	234 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	TCF19	Q9Y242	345 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	C17orf98	A8MV24	154 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CHST1	O43916	411 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FBXO24	O75426	580 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ALDOB	P05062	364 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ARG1	P05089	322 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF728	P0DKX0	622 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SRM	P19623	302 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FST	P19883	344 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	RBP2	P50120	134 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	MTCP1	P56278	107 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM189A2	Q15884	450 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	DDI2	Q5TDH0	399 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	KCTD7	Q96MP8	289 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	GPER1	Q99527	375 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028		F8VVB4	439 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028		F8VWA3	439 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PDCD5	O14737	125 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ALX3	O95076	343 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PAX6	P26367	422 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	EDDM3B	P56851	147 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	COL10A1	Q03692	680 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028		Q8N2B8	174 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PIFO	Q8TCI5	191 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	RFT1	Q96AA3	541 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CEP19	Q96LK0	163 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SPACA5	Q96QH8	159 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4F4	Q96R69	305 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	CENPO	Q9BU64	300 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF702P	Q9H963	129 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	hADV38S2	A0JD32	116 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	MEGF11	A6BM72	1044 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ODF3B	A8MYP8	253 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	POU3F4	P49335	361 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	DYNLT3	P51808	116 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	DLX6	P56179	175 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	SSX2	Q16385	188 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	PLA1A	Q53H76	456 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF626	Q68DY1	528 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028		Q8IYB0	196 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG11-208	ENST00000437028	OR8H2	Q8N162	312 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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