RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	KDM4B	O94953	1096 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CGB3	P0DN86	165 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CGB7	P0DN87	165 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	RAB7A	P51149	207 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	DAP	P51397	102 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	BNIP1	Q12981	228 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	FAHD1	Q6P587	224 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445		Q8NFD4	153 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OPALIN	Q96PE5	141 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	PSG11	Q9UQ72	335 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	APOL3	O95236	402 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	EPHA2	P29317	976 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GLP1R	P43220	463 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CHST4	Q8NCG5	386 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	FGGY	Q96C11	551 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	DEGS1	O15121	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	FKBP6	O75344	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	FAM107A	O95990	144 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OCM2	P0CE71	109 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF20	P17024	532 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CALB2	P22676	271 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GPR12	P47775	334 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GNG10	P50151	68 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GNGT1	P63211	74 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GPR50	Q13585	617 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	EBI3	Q14213	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	CDK5R1	Q15078	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	C12orf73	Q69YU5	71 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	ABCG5	Q9H222	651 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	SORL1	Q92673	2214 aa		10.77	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
RAB17-208	ENST00000430445	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	ZAR1L	A6NP61	321 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	HSPB6	O14558	160 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	IL1A	P01583	271 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	ELANE	P08246	267 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	ISL1	P61371	349 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	FOXE3	Q13461	319 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	FHL3	Q13643	280 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	LTC4S	Q16873	150 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	SPATA24	Q86W54	205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	MBOAT4	Q96T53	435 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	THTPA	Q9BU02	230 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RAB17-208	ENST00000430445	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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