RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 OR1L3Q8NH93 324 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF2Q99496 336 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK15Q9H427 330 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 OGG1O15527 345 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 KIR2DS2P43631 304 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT1A2P50226 295 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 SPINK9Q5DT21 86 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF766Q5HY98 468 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX22Q96L94 193 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00052Q96N35 136 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 MANBALQ9NQG1 85 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 CREBBPQ92793 2442 aa9.71□□□□□ -0.85
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST1O43916 411 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 P2RY1P47900 373 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PDPNQ86YL7 162 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6X1Q8NH79 312 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB33BQ9H082 229 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 B4DEV8 164 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf94C9JXX5 98 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R2Z0 102 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MFNGO00587 321 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM6P0DI80 62 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 COX7A1P24310 79 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT1A1P50225 295 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PRRX1P54821 245 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 RAC3P60763 192 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 VAX2Q9UIW0 290 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 NAGKQ9UJ70 344 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN1AP35498 2009 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL3P20749 454 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNLT3P51808 116 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 B2MP61769 119 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 COL19A1Q14993 1142 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 KLK10O43240 276 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-13P01766 116 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-7P01780 117 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LYZP61626 148 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 FDX2Q6P4F2 183 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 GUSBP11Q6P575 273 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PECRQ9BY49 303 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LYZL6O75951 148 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CDS2O95674 445 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4A8P0C604 315 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 COL8A1P27658 744 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS12P56730 875 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD4Q96DR4 205 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP5SQ99766 215 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM74A7A6NL05 159 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SOCS1O15524 211 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 G6PCP35575 357 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB2P49721 201 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MPV17LQ2QL34 196 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 IGSF11Q5DX21 431 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TSC2P49815 1807 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM157AC9JC47 383 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PPYP01298 95 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CT62P0C5K7 136 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PET117Q6UWS5 81 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 DHRS13Q6UX07 377 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms