RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 TPRX1Q8N7U7 411 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 COQ2Q96H96 371 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 DIRAS2Q96HU8 199 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 WDFY2Q96P53 400 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 FAM234AQ9H0X4 552 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 HSF4Q9ULV5 492 aa23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 A0A0A6YYH2 397 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 A6NJ64 397 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 PTHLHP12272 177 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 GNB2P62879 340 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 AESQ08117 197 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 ESCO2Q56NI9 601 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 PPP1R35Q8TAP8 253 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 ETAA1Q9NY74 926 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 AK3Q9UIJ7 227 aa23.39■■□□□ 1.34
GIPC1-202ENST00000393028 WNK2Q9Y3S1 2297 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM235A6NFC5 223 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 FAM157AC9JC47 383 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 MGST3O14880 152 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 CDNFQ49AH0 187 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 GDPD3Q7L5L3 318 aa23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 H3BUI4 141 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 TALDO1P37837 337 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 EDDM3BP56851 147 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF260Q3ZCT1 412 aa23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 CSN2P05814 226 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 KRBOX4Q5JUW0 171 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.336e-7■□□□□ 9.8
GIPC1-202ENST00000393028 OR5D13Q8NGL4 314 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 LPAR2Q9HBW0 351 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 GLAP06280 429 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 GLIPR1P48060 266 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 SNX29P2Q8IUI4 249 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 AUNIPQ9H7T9 357 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 KIF25Q9UIL4 384 aa23.36■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 HEXAP06865 529 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 NPY4RP50391 375 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 P2RX3P56373 397 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 LCN2P80188 198 aa23.35■■□□□ 1.33
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GIPC1-202ENST00000393028 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 C19orf12Q9NSK7 152 aa23.35■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 TEX15Q9BXT5 2789 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 TRAV39A0A0B4J263 110 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 A0A0G2JMP0 313 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 A0A0X1KG70 313 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 C22orf46C9J442 243 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 H7C1Q1 480 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 KCNJ3P48549 501 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF497Q6ZNH5 498 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC190Q86UF4 302 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 OR4M2Q8NGB6 313 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 DCTN5Q9BTE1 182 aa23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 OTOGQ6ZRI0 2925 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 SERPINE3A8MV23 424 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 HLA-DQB1P01920 261 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 MNDAP41218 407 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 GUCA2AQ02747 115 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 ARFRP1Q13795 201 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 IL18Q14116 193 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 HACD4Q5VWC8 232 aa23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 A8MXK9 166 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 CD3GP09693 182 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 Q6ZPA2 131 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 OR4K15Q8NH41 348 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC107Q8WV48 283 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 V9GYH0 126 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 MEIKINA0A087WXM9 373 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 ODAMA1E959 279 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 GNG2P59768 71 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 RPL31P62899 125 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 ARL6IP1Q15041 203 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 SLC35E4Q6ICL7 350 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 FAM131AQ6UXB0 335 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 TCF23Q7RTU1 214 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 FAM185AQ8N0U4 392 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-202ENST00000393028 ABHD1Q96SE0 405 aa23.31■■□□□ 1.32
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