RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 DNAJC13O75165 2243 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 IFNL4K9M1U5 179 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OPN1MWP04001 364 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OR5AC1P0C628 307 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 DHRS2Q13268 280 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SHISA5Q8N114 240 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 TEX29Q8N6K0 151 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 GSX2Q9BZM3 304 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RAXQ9Y2V3 346 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SLC25A4P12235 298 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 CD59P13987 128 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 AKR1C3P42330 323 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RAB5CP51148 216 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 R3HDM4Q96D70 268 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RNF122Q9H9V4 155 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 XKRY2A2RUG3 117 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 COL10A1Q03692 680 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 AESQ08117 197 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 COA4Q9NYJ1 87 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 KPTNQ9Y664 436 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 VSIG8P0DPA2 414 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 TNFSF10P50591 281 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ERVFRD-1P60508 538 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 C9orf172C9J069 976 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 CCL13Q99616 98 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 GP6Q9HCN6 339 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OR5H1A6NKK0 313 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 GYPAP02724 150 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 KIR3DL2P43630 455 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 NTNG2Q96CW9 530 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ZNF488Q96MN9 340 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 C9orf170A2RU37 121 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 MGST3O14880 152 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 AVPI1Q5T686 147 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ATP5J2P56134 94 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ZNF596Q8TC21 504 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ABHD1Q96SE0 405 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ZNF727A8MUV8 499 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 DCTN6O00399 190 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 B3GALNT1O75752 331 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 IL13RA2Q14627 380 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 NINQ8N4C6 2090 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 PPYP01298 95 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 COX5BP10606 129 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 IRF3Q14653 427 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 OR8G5Q8NG78 346 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 BCL2L11O43521 198 aa8.93□□□□□ -0.98
PKP4-201ENST00000389757 CD37P11049 281 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms