RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SRD5A2P31213 254 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 OR4A16Q8NH70 328 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM230Q96A57 120 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM38BQ9NVV0 291 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 GNG3P63215 75 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 F8VVB4 439 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 F8VWA3 439 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 DANCRP0C864 163 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 LIFP15018 202 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 COX5AP20674 150 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 IL11RAQ14626 422 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 BIVMQ86UB2 503 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A45Q8N413 288 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 SMIM8Q96KF7 97 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 Q96M66 194 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 ATP5SQ99766 215 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 FAM117AQ9C073 453 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 CACNA1EQ15878 2313 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRU-201ENST00000345512 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 LY86O95711 162 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CD46P15529 392 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 BCL3P20749 454 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 RARRES2Q99969 163 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 OR2H1Q9GZK4 316 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 LDLRAD4O15165 306 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 KLK2P20151 261 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNHIT1O43257 154 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CA6P23280 308 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FAM209BQ5JX69 171 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CEP350Q5VT06 3117 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 KITLGP21583 273 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ABHD3Q8WU67 409 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1456Q9P272 454 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF319Q9P2F9 582 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CACNA1DQ01668 2161 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 YKT6O15498 198 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CCL4P13236 92 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF92Q03936 586 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 OR8G1Q15617 311 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ACER2Q5QJU3 275 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MESP1Q9BRJ9 268 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 OPA3Q9H6K4 179 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SYNGR2O43760 224 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 FGF7P21781 194 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MLF1P58340 268 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2G2P60604 165 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SLC38A11Q08AI6 406 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 OR10V1Q8NGI7 309 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 OR10S1Q8NGN2 331 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SNX22Q96L94 193 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 H0YL77 283 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DMRTA2Q96SC8 542 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0A6YYD4 124 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF737O75373 536 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 OR8B8Q15620 311 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM241Q24JQ0 296 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 BTF3L4Q96K17 158 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A22Q9H936 323 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 DENND4CQ5VZ89 1909 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PR77 199 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 SPINT2O43291 252 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 CEACAM6P40199 344 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 PSG4Q00888 419 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TIAF1O95411 115 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 MBP02144 154 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 HNF1AP20823 631 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM187Q14656 261 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 BAGE3Q86Y29 109 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 BAGE2Q86Y30 109 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF383Q8NA42 475 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms