RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2V2Q96R30 315 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 HES4Q9HCC6 221 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2H2O95918 312 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 HAND1O96004 215 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 KNG1P01042 644 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TK1P04183 234 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF1AP19438 455 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHA1P21709 976 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 FPR2P25090 351 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 LMO1P25800 156 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ3P48549 501 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 NPY4RP50391 375 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 GMFBP60983 142 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 CD300CQ08708 224 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 FCN2Q15485 313 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ADIPOQQ15848 244 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 BEX5Q5H9J7 111 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 SHEQ5VZ18 495 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF626Q68DY1 528 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf88Q6PI97 169 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01560Q8TB33 94 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC29Q8WV35 223 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 Q9N2K0 584 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF222Q9UK12 451 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR132Q9UNW8 380 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 CADP27708 2225 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2AT4A6NND4 320 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TRDCB7Z8K6 153 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRPB1O00241 398 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPB6O14558 160 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMA5O15230 3695 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTT2P0CG29 244 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA3P12429 323 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR1C4P17516 323 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP20933 346 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 IL13RA1P78552 427 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP69Q49AA0 526 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SPICQ8N5J4 248 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 DYRK2Q92630 601 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM165Q9HC07 324 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF7Q9UBF6 113 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 VSIG4Q9Y279 399 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 NPTNQ9Y639 398 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC30A6NM36 301 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf100A8MU93 164 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R233 179 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP7O15540 132 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 DIRAS3O95661 229 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV1-46P01743 117 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.5 ms