RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 IL11P20809 199 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KITLGP21583 273 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FHITP49789 147 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DYNLT3P51808 116 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FUT6P51993 359 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 IQCJQ1A5X6 159 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 Q3ZCU0 254 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 UHRF2Q96PU4 802 aa14.95□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GTI1 187 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LIPT2A6NK58 231 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OPN1MWP04001 364 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 EGR4Q05215 589 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MPV17LQ2QL34 196 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DOK5Q9P104 306 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DEGS1O15121 323 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PDCD6O75340 191 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DEDDO75618 318 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PMS2P11Q13670 270 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 M1APQ8TC57 530 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SARAFQ96BY9 339 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GPR87Q9BY21 358 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PR80 420 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LRP5LA4QPB2 252 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 LYPD3O95274 346 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ISG15P05161 165 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FREM3P0C091 2139 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SRD5A2P31213 254 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DCAF10Q5QP82 559 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.94□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 STPG1Q5TH74 334 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NXPH2O95156 264 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 IL2RAP01589 272 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TRGC2P03986 189 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 FGF5P12034 268 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PKIAP61925 76 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TEX30Q5JUR7 227 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR2M3Q8NG83 312 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 G3V3Q6 166 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TCAPO15273 167 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GRPP07492 148 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CFHR1Q03591 330 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 VOPP1Q96AW1 172 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 COX5AP20674 150 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MAGEA5P43359 124 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF90Q03938 601 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 RHOVQ96L33 236 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CHST1O43916 411 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GALR1P47211 349 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 GGACTQ9BVM4 153 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1456Q9P272 454 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 B4E171 279 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 IGKV3-11P04433 115 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 IRF2P14316 349 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 TSPAN7P41732 249 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ERVS71-1P61550 626 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MPPED1O15442 326 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 KLK2P20151 261 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF154Q13106 437 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 OR6X1Q8NH79 312 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRG7Q96K78 797 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 V9GYS6 101 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF708P17019 499 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms