RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT6P51993 359 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MTCP1P56278 107 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM50BP56557 158 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC10A1Q14973 349 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NRN1LQ496H8 165 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MOB3CQ70IA8 216 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC18Q8N456 261 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SPERTQ8NA61 448 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM104Q8NE00 496 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 STOML3Q8TAV4 291 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL11Q969Q4 196 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NABP1Q96AH0 204 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 REEP6Q96HR9 211 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC22AQ96IW7 307 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CXorf58Q96LI9 332 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 GNRHR2Q96P88 292 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SPACA5Q96QH8 159 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT3Q9BQG1 590 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NICN1Q9BSH3 213 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BCO1Q9HAY6 547 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD2Q9UBB5 411 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CCSO14618 274 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CD5LO43866 347 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RAMP1O60894 148 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC6AO75865 159 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR3BO95264 441 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNGR4O95473 234 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NRASP01111 189 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM157CP0CG43 387 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LYL1P12980 280 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FAHP16930 419 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINA2P20848 420 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CNR1P21554 472 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 GLP1RP43220 463 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR5AP47898 357 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 NPY4RP50391 375 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5J2P56134 94 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BLOC1S1P78537 153 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXO1Q12778 655 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8B8Q15620 311 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 BAP18Q8IXM2 172 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1S1Q8NH92 325 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF141Q8WVD5 230 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MARC2Q969Z3 335 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM45BQ96B21 275 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 LYZL4Q96KX0 146 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 Q96M66 194 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 IL36GQ9NZH8 169 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.03□□□□□ -1.44
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 F8VVB4 439 aa6.02□□□□□ -1.45
SMARCE1-201ENST00000264640 F8VWA3 439 aa6.02□□□□□ -1.45
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