RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SPINT2O43291 252 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 HLA-HP01893 362 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PATE4P0C8F1 98 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SPP1P10451 314 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 HOXA6P31267 233 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SULT1A1P50225 295 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 IGFBP7Q16270 282 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CYB5BO43169 146 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RAB5AP20339 215 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CRYGSP22914 178 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 RAB11AP62491 216 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NABP1Q96AH0 204 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 DDA1Q9BW61 102 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 Q9N2K0 584 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF98A6NK75 572 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A20A6NK97 555 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 J3QT63 122 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R2P9O14990 202 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 H3F3AP84243 136 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BRICD5Q6PL45 260 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR2M7Q8NG81 312 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 AP4M1O00189 453 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SIRPB1O00241 398 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SOX15O60248 233 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA6P56556 154 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PKIBQ9C010 78 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 C12orf49Q9H741 205 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TUBA4BQ9H853 241 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 GNG13Q9P2W3 67 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SMCO3A2RU48 225 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ADAM10O14672 748 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF12O43508 249 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OR8U1Q8NH10 309 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZFP92A6NM28 416 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 CST7O76096 145 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 PDCD1Q15116 288 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 KHDC3LQ587J8 217 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 LYPD6Q86Y78 171 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 BATF2Q8N1L9 274 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 NIT2Q9NQR4 276 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPV4 95 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 VSTM5A8MXK1 200 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 C10orf142B7Z368 130 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 J3QW42 95 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 K7ESF4 209 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0CP27449 155 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 NANPQ8TBE9 248 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 GALMQ96C23 342 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.65□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPH5 198 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 CHST1O43916 411 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 NXPH3O95157 252 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 UMODP07911 640 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 MEOX1P50221 254 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 BATFQ16520 125 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 ABHD3Q8WU67 409 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 DYRK2Q92630 601 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 TMEM131Q92545 1883 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 TMEM210A6NLX4 147 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 FOLR2P14207 255 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 COX5AP20674 150 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 ASCL4Q6XD76 172 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-201ENST00000264345 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.64□□□□□ -1.19
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