RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 IFNA5P01569 189 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 FOSL2P15408 326 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ANOS1P23352 680 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 RAB7AP51149 207 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 PPP1CAP62136 330 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF92Q03936 586 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF695Q8IW36 515 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 OR51I2Q9H344 312 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 TNFSF13O75888 250 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 OR1D4P47884 311 aa6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 RTP5Q14D33 572 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 GAB4Q2WGN9 574 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 OOSP2Q86WS3 158 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 PATE1Q8WXA2 126 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 IL22RA2Q969J5 263 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.27□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ADAM20O43506 726 aa6.26□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 BIDP55957 195 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 HERV-K104P61576 105 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 SRPXP78539 464 aa6.26□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 UEVLDQ8IX04 471 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 EXTL1Q92935 676 aa6.26□□□□□ -1.41
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CSDE1-201ENST00000261443 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 C20orf202A1L168 122 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 FRG2CA6NGY1 282 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 MPPED1O15442 326 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CHST1O43916 411 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CHRNB4P30926 498 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CDAP32320 146 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 BPIFB3P59826 476 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 TLE3Q04726 772 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 TDRG1Q3Y452 100 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 D2HGDHQ8N465 521 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 FGF14Q92915 247 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 AGMATQ9BSE5 352 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 OR51B6Q9H340 312 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 VSIRQ9H7M9 311 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.26□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 A0A1B0GUS0 222 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 RER1O15258 196 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF737O75373 536 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 KBTBD11O94819 623 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 ADH1BP00325 375 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CD33P20138 364 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 CCL1P22362 96 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 DTYMKP23919 212 aa6.25□□□□□ -1.41
CSDE1-201ENST00000261443 RANP62826 216 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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