RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PI3P19957 117 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 NTF4P34130 210 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ3P48549 501 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 KISS1Q15726 138 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST3H3Q16695 136 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ARV1Q9H2C2 271 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 STARD10Q9Y365 291 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA5P05154 406 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 UCP2P55851 309 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM6P62312 80 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A2Q6IF42 318 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF561Q8N587 486 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF283Q8N7M2 679 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 OXGR1Q96P68 337 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0U1RQV5 110 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CYTIPO60759 359 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR3BO95264 441 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A9P06702 114 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR2AP12318 317 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR2CP31995 323 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CD80P33681 288 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZSR3 168 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM214BQ7L5A3 538 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A13Q99584 98 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SFXN3Q9BWM7 321 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf49Q9H741 205 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ16Q9NPI9 418 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC11BP0C7V7 166 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 OPRM1P35372 400 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB5CP51148 216 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35A1P78382 337 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZRG5 221 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF144BQ7Z419 303 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF716A6NP11 495 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CGAP01215 116 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM57BQ71RH2 274 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL17Q9UF56 701 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR14LQ5THK1 2151 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 MCEMP1Q8IX19 187 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 JKAMPQ9P055 326 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 V9GYS6 101 aa22.6■■□□□ 1.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf52A6NGY3 159 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 E5RGE8 158 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 IL18BPO95998 194 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR157Q5UAW9 335 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF610Q8N9Z0 462 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PGAM5Q96HS1 289 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR13Q9NZ81 148 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 NSG2Q9Y328 171 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF726A6NNF4 738 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN15O95858 294 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM33P57088 247 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 C2CD4CQ8TF44 421 aa22.59■■□□□ 1.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 KNG1P01042 644 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A6P06703 90 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf79Q96F83 325 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 BCO1Q9HAY6 547 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 AMDHD2Q9Y303 409 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MXE2 369 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RER1O15258 196 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF43P17038 809 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BAQ96A08 127 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP7P3A6NL99 342 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 DNPH1O43598 174 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 QDPRP09417 244 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A1P11166 492 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SNCAP37840 140 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF251Q9BRH9 671 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX7Q9BT81 388 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST5Q9GZS9 411 aa22.57■■□□□ 1.2
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