RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640939.1

GRAMD1B-217, Transcript of GRAM domain containing 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD1B, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1B-217ENST00000640939 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.01■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 FBXO3Q9UK99 471 aa28.01■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 F8W031 263 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 MTX1Q13505 466 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 NBPF9Q3BBW0 867 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 JMYQ8N9B5 988 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 BCAMP50895 628 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 PANK1Q8TE04 598 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.99■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 SLC5A1P13866 664 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 SULF1Q8IWU6 871 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 WNT10BO00744 389 aa27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 LPIN2Q92539 896 aa27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.97■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 RASSF10A6NK89 507 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATP2B3Q16720 1220 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.96■■■□□ 2.07
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 VEGFBP49765 207 aa27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 MMP14P50281 582 aa27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.95■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.94■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.93■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 DLGAP5Q15398 846 aa27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 CDCA5Q96FF9 252 aa27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.92■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 TFCP2Q12800 502 aa27.91■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 CFAP100Q494V2 611 aa27.91■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 PCNTO95613 3336 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 GRIK5Q16478 980 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 MS4A1P11836 297 aa27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADORA1P30542 326 aa27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATP8B2P98198 1209 aa27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 GRM1Q13255 1194 aa27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 TIMM10P62072 90 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 POLA2Q14181 598 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 CAPNS2Q96L46 248 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 AOX1Q06278 1338 aa27.87■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 SPDYE6P0CI01 402 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 PHKA1P46020 1223 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 SSH3Q8TE77 659 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 COG6Q9Y2V7 657 aa27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 CLRN2A0PK11 232 aa27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 HUNKP57058 714 aa27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 C2orf69Q8N8R5 385 aa27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.85■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 A0A1B0GUL7 405 aa27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.84■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.83■■■□□ 2.05
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYO1BO43795 1136 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 ECE1P42892 770 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 CRKP46108 304 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCDC102BQ68D86 513 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEP85Q6P2H3 762 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 XAGE2Q96GT9 111 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.82■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 VEZTQ9HBM0 779 aa27.81■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 AOC2O75106 756 aa27.8■■■□□ 2.04
GRAMD1B-217ENST00000640939 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms