RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637239.2

TCF4-285, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 7,771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-285	ENST00000637239	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SNRK	Q9NRH2	765 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CASQ1	P31415	396 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SYCE3	A1L190	88 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ATP2B4	P23634	1241 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SP4	Q02446	784 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GNA11	P29992	359 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RTN1	Q16799	776 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RNF34	Q969K3	372 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GRM8	O00222	908 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SMTN	P53814	917 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ERICH4	A6NGS2	130 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	IDE	P14735	1019 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	HOXC9	P31274	260 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	DPP9	Q86TI2	863 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CERK	Q8TCT0	537 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	TEKT1	Q969V4	418 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	KDM5C	P41229	1560 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ZFYVE9	O95405	1425 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	DNA2	P51530	1060 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CCDC14	Q49A88	953 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CCDC93	Q567U6	631 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	BACH2	Q9BYV9	841 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ESPN	B1AK53	854 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239		F6X3S4	739 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ABI1	Q8IZP0	508 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	FERMT3	Q86UX7	667 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PPM1E	Q8WY54	764 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	TMX1	Q9H3N1	280 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	PNMA3	Q9UL41	463 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	TNNT1	P13805	278 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CFAP58	Q5T655	872 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SPON1	Q9HCB6	807 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	USP16	Q9Y5T5	823 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GLI2	P10070	1586 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	MYZAP	P0CAP1	466 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	INCENP	Q9NQS7	918 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SH3BP5	O60239	455 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ZBTB43	O43298	467 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	STAT6	P42226	847 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CNNM3	Q8NE01	707 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	KIF5C	O60282	957 aa		7.46	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	CBX1	P83916	185 aa		7.46	□□□□□ -1.21
TCF4-285	ENST00000637239	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21

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