RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	CERS5	Q8N5B7	392 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TCF4-259	ENST00000627568	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		32.2	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	MYO1B	O43795	1136 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	METTL24	Q5JXM2	366 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	GYG1	P46976	350 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	MOB2	Q70IA6	237 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	LRRC24	Q50LG9	513 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TCF4-259	ENST00000627568	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.13	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	ABHD8	Q96I13	439 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	PDE8B	O95263	885 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	TRPA1	O75762	1119 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	PRKG1	Q13976	671 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	VEZT	Q9HBM0	779 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TCF4-259	ENST00000627568	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	EYA2	O00167	538 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	TNFAIP1	Q13829	316 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TCF4-259	ENST00000627568	SLC5A1	P13866	664 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	BCAM	P50895	628 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	DGKZ	Q13574	1117 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	FGFR2	P21802	821 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	CRK	P46108	304 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	FBXO3	Q9UK99	471 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	AOX1	Q06278	1338 aa		32	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	SREBF2	Q12772	1141 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	RASA3	Q14644	834 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	LPIN2	Q92539	896 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	MAP3K11	Q16584	847 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	SIL1	Q9H173	461 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
TCF4-259	ENST00000627568	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms