RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 CERS5Q8N5B7 392 aa36.27■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 BEGAINQ9BUH8 593 aa36.26■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE8BO95263 885 aa36.25■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 BCAR3O75815 825 aa36.24■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 DLGAP5Q15398 846 aa36.24■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP2K2P36507 400 aa36.23■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 CAVIN4Q5BKX8 364 aa36.23■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 EYA2O00167 538 aa36.22■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 MEIS3Q99687 375 aa36.22■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa36.21■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 RGMBQ6NW40 437 aa36.2■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 TNS4Q8IZW8 715 aa36.2■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 SIL1Q9H173 461 aa36.2■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM205AQ6ZU69 1335 aa36.19■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP36.19■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 MFSD14BQ5SR56 506 aa36.19■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 VGLL2Q8N8G2 317 aa36.19■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 GNAI3P08754 354 aa36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 CLUAP1Q96AJ1 413 aa36.18■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM27P14373 513 aa36.17■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 CFAP100Q494V2 611 aa36.17■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXO33Q7Z6M2 555 aa36.17■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 NF2P35240 595 aa36.16■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 LBX1P52954 281 aa36.16■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 NOGQ13253 232 aa36.16■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 MYO1BO43795 1136 aa36.15■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC102AQ96A19 550 aa36.15■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 BCAMP50895 628 aa36.14■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 FKBP1BP68106 108 aa36.14■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 TNNQ9UQP3 1299 aa36.14■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa36.14■■■■□ 3.38
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC5A1P13866 664 aa36.13■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MTMR14Q8NCE2 650 aa36.13■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa36.12■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ATG9AQ7Z3C6 839 aa36.12■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PRDM10Q9NQV6 1147 aa36.12■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 CEP126Q9P2H0 1117 aa36.12■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 LPIN2Q92539 896 aa36.11■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXO3Q9UK99 471 aa36.11■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 THSD7BQ9C0I4 1608 aa36.11■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 CLRN2A0PK11 232 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SPDYE2BA6NHP3 402 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 CIAO1O76071 339 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 SPDYE6P0CI01 402 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 FGFR2P21802 821 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 MOB2Q70IA6 237 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 VEZTQ9HBM0 779 aa36.1■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 ZIC5Q96T25 663 aa36.09■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 UBE2Q2LH0YL09 131 aa36.08■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 PRKG1Q13976 671 aa36.08■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa36.08■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB129Q9H1M3 183 aa36.08■■■■□ 3.37
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 SRGAP3O43295 1099 aa36.07■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 IL15P40933 162 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP2B3Q16720 1220 aa36.07■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TSKSQ9UJT2 592 aa36.07■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 SERPINA10Q9UK55 444 aa36.06■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 GNAI2P04899 355 aa36.05■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 COPRSQ9NQ92 184 aa36.05■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC10A3P09131 477 aa36.04■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM57Q8N5G2 664 aa36.04■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa36.04■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 CA12O43570 354 aa36.03■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 ARMC9Q7Z3E5 817 aa36.03■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 CRKP46108 304 aa36.02■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 GRIK5Q16478 980 aa36.02■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 RASAL3Q86YV0 1011 aa36.01■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa36.01■■■■□ 3.36
SEMA3B-215ENST00000621029 AOX1Q06278 1338 aa36.01■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms